1.
继发于其它疾病和原因所导致的骨髓衰竭或造血异常:诊断幼年性难治性血细胞减少,需除外下列(但不限于)疾病或原因所导致的类似临床症状和血液系统异常: 感染(如病毒)、维生素B12和叶酸缺乏、药/毒物、自身免疫性疾病、化疗、代谢疾病、阵发性夜间血红蛋白尿、先天遗传性骨髓衰竭病症,等。
2.
再生障碍性贫血:骨髓增生/细胞密度极度低下,无明显成红细胞增多或造血岛存在,无明显异型性。遗传学检测也有助鉴别。
3.
唐氏综合症(Down Syndrome):有的病例可表现为长期MDS样临床症状和血液系统异常,与幼年性难治性血细胞减少相似。病史和遗传学可以鉴别。
4.
急性髓系白血病伴重现性遗传学异常:部分病例原始细胞少于20%或呈现低增生性骨髓,需与幼年性难治性血细胞减少相鉴别。