几乎全部阳性（≥95%的病例阳性）：
actin-HHF-35、CAM 5.2、CK-PAN、SF-1、CD56、Desmin、S100、Vimentin、SMA通常阳性（<95%，≥75%的病例阳性）：
Inhibin、FOXL2、CD99、Calretinin有时阳性（<55%，≥35%的病例阳性）：
WT-1几乎全部阴性（<5%的病例阳性）：
CgA、CK5/6、EpCAM、PLAP、SALL41. 通常发生于30岁以前，平均发病年龄15岁；
2. 囊实性最常见，囊内可含有血性液体。也可为实性或完全囊性变；后者常为多房，罕见单房。实性区通常为黄褐色或灰白色，偶尔可见广泛的坏死和(或)出血
3. 镜下典型表现为肿瘤细胞弥漫或结节状分布，其间穿插大小和形状不一的滤泡，但也可以是规则的圆形和卵圆形滤泡；
4. 滤泡腔内含有嗜酸性，偶尔为嗜碱性分泌物，大约2/3的病例呈黏液卡红染色阳性；
5. 滤泡内衬粒层细胞，细胞层数不同使得滤泡壁薄厚不一，周围可有卵泡膜细胞围绕，经常可见滤泡衬覆的粒层细胞与周围卵泡膜细胞区融合；
6. 有时可见粒层细胞衬覆于假乳头结构；
7. 极少数情况下，衬覆细胞类似于靴钉样细胞；
8. 与成人型不同，粒层细胞核通常呈圆形、深染，罕见核沟；细胞质通常丰富、嗜酸性(黄素化)；
9. 少数病例可见小灶区域具有成人型粒层细胞瘤样形态，诊断时应以主要成分为依据；
10. 约10-15％的病例可见核异型，核分裂像多少不一，一般较多见；
11. 肿瘤中的卵泡膜细胞常常黄素化，少数病例以卵泡膜细胞为主；
12. 偶尔，粒层细胞和卵泡膜细胞错综复杂地混杂在一起；
13. 间质常稀少，偶尔间质增生明显伴硬化，隐盖了肿瘤的特点；
14. 有时间质可见嗜碱性基质；
15. 罕见钙化。
16. 极少数病例与普通肿瘤相比，肿瘤细胞核异型性十分显著，但结构规则，肿瘤中可见成片生长的区域，就像未分化癌，充分取材并发现典型的滤泡结构可诊断间变性幼年型粒层细胞瘤。
幼年型粒层细胞瘤（20x）: 低倍镜下可见小叶状结构和滤泡样结构
幼年型粒层细胞瘤（10x）: 小叶状结构和滤泡样结构， 滤泡内常常可见嗜碱性分泌物
幼年型粒层细胞瘤（400x）: 细胞核没有核沟，核分裂像易见
幼年型粒层细胞瘤（400x）: 肿瘤细胞有时候细胞质嗜酸性，类似黄素化，注意细胞核没有核沟，本例核分裂像多
1.成年型粒层细胞瘤：
成年型与幼年型粒层细胞瘤的鉴别:
| 成年型 | 幼年型 |
| 青春期前患者不到1% | 青春期前患者占50% |
| 多见于30岁后 | 多见于30岁前 |
| 可见微滤泡（Call-Exner小体） |
卵泡大小形状不一，含有黏液 ，罕见Call-Exner小体 |
| 细胞核淡染，成角，常见核沟 | 细胞核深染，圆形，罕见核沟 |
| 肿瘤细胞黄素化不常见 | 肿瘤细胞黄素化常见 |
2.卵泡膜细胞瘤：少数JGCT缺乏或罕见滤泡结构、肿瘤细胞质丰富并且偶尔以卵泡膜细胞为主。
1. 幼年型卵泡膜细胞瘤经充分取材可找到滤泡结构；
2. 网状纤维染色证实至少部分肿瘤细胞周围网状纤维稀少，为粒层细胞；
3. 卵泡膜细胞瘤中核分裂像罕见，多发生30岁以后，与幼年型粒层细胞瘤相反；
4. 免疫组织化学染色可助鉴别诊断。
3.类固醇细胞瘤：黄素化JGCT中局灶的弥漫性结构可能提示类固醇细胞瘤的诊断
1. 类固醇细胞瘤的组织学结构和细胞学形态单一，这种情况JGCT少见；
2. 充分取材幼年型粒层细胞瘤总会含有更具有诊断性特征的区域；
3. 免疫组织化学染色可助鉴别诊断。