1.非典型脂肪肿瘤:痣细胞CD34及MDM2都阴性,而SOX10阳性,可鉴别脂肪母细胞;
2.梭型细胞脂肪瘤:病变中的梭型细胞CD34阳性,而痣细胞CD34阴性;
3.表皮神经嵴错构瘤:其可见到明显不成熟横纹肌及不成熟神经细胞成份;
4.恶性黑色素瘤:气球样黑色素细胞在良性黑色素痣及恶性黑色素瘤都可见到,加上个别不典型大细胞,需要与恶黑鉴别,但低Ki67,对称性生长,大核细胞核染色质呈模糊样,成熟型生长等都支持良性黑痣。