几乎全部阳性（≥95%的病例阳性）：
CD20、GAP43、IRF-4、P-4EBP1、PNL2、SNF5、SOX10、Vimentin通常阳性（<95%，≥75%的病例阳性）：
BCL-2、CD146、KBA62、melan-A、MITF、HMB45、S100经常阳性（<75%，≥55%的病例阳性）：
CD57、E-cadherin有时阳性（<55%，≥35%的病例阳性）：
mdm2、Tyrosinase少数阳性（<35%，≥15%的病例阳性）：
actin-HHF-35、Cathepsin-K、HER2、met、CD117、CD56、NSE、Synaptophysin偶尔阳性（<15%，≥5%的病例阳性）：
CK-PAN、N-cadherin、ULEX - 1、TLE1、CD34、CD99几乎全部阴性（<5%的病例阳性）：
AE1/AE3、CAM 5.2、CDK4、FLI-1、FVIII、FVIIIA、FVIIIRAg、FXIIIA、GATA3、HCAD、Inhibin、NY-ESO-1、P53、P63、p-AKT、p-mTOR、TAG72、vegfr2、Brachyury、CEA-P、CD15、CD163、CD19、CD3、CD30、CD31、CD45、CD5、CD68、CD79a、CgA、CK20、CK7、Desmin、DOG1、GFAP、MUC4、Myogenin、TFE3、WT-1、SMA、TDT2.界限清晰，无包膜，分叶状或结节状，质地坚实，切面呈灰白色，可见点状或斑状暗褐色或黑色区；
3.镜下由束状、巢状或片状的瘤细胞组成，其间为纤细的结缔组织间隔分隔；
4.瘤细胞呈多边形、卵圆形或胖梭形，胞质丰富嗜酸性或透亮，核呈圆形或卵圆形，淡染或呈空泡状，可见明显的嗜伊红色或嗜双色性核仁，有时可见多核瘤巨细胞；
5.可见核分裂像，一般<3～5个／10HPF；
6.部分病例瘤细胞内可见黑色素颗粒，少数病例可见间质明显的黏液变性。
HMB45
肿瘤细胞由纤细的结缔组织间隔所分隔，可见散在的瘤巨细胞
瘤细胞胞浆丰富，嗜酸性或浅染，核仁显著，可见散在的细胞内黑色素沉积
表达HMB45
表达S100蛋白
瘤细胞呈巢状和梁状排列，分布于硬化性间质之中
瘤细胞胞浆较丰富，嗜酸性或透明，核圆形或短梭形，核仁显著，核分裂象较活跃。
瘤细胞呈挤压的巢状分布于致密的硬化性间质之中
瘤细胞胞浆丰富，嗜酸性或透明，可见显著的核仁
免疫组化染色表达MITF
免疫组化染色表达SOX10
瘤细胞呈巢状和片状分布于硬化的纤维性间质之中
瘤细胞胖梭形，胞浆丰富嗜酸性，大小较一致，核分裂象较少见
间质可见散在的黑色素沉积
局部瘤细胞黏附性较差形成假血管瘤样结构
部分可见多核瘤巨细胞，注意胞浆内外的棕色黑色素性颗粒
恶性黑色素瘤：表面或邻近皮肤交界性病变存在。瘤细胞多形性和异型性均较明显，核分裂像易见，检测EWSR1-ATF1融合基因有助于鉴别诊断。
胃肠道透明细胞肉瘤样肿瘤（胃肠道神经外胚层肿瘤，GNET）：与软组织透明细胞肉瘤具有相似的遗传学特征包括EWSR1-ATF1融合以及EWSR1-CREB1融合基因。与软组织透明细胞肉瘤不同，GNET瘤细胞大小相对一致，核仁不明显，间质内可见破骨样巨细胞分布，无瘤巨细胞形成。免疫组化染色表达S100蛋白和SOX10以及神经内分泌标志物，不表达黑色素细胞相关标志物如HMB45和MELAN-A等。
恶性外周神经鞘膜瘤：常与NF1或2相关，半数以上的肿瘤起源于先前存在的神经，瘤细胞梭形束状排列为主，免疫组化染色斑驳状表达S100蛋白或SOX10，特征性的显示H3K27ME3表达缺失，不表达黑色素细胞相关标志物。