临床常无症状，症状常与重要器官的占位压迫或移位有关，可见胆管压迫、细菌感染、破裂伴胆管炎及破入腹腔或胸腔，少数可压迫门静脉及引起门脉高压，囊液具有高致敏性，泄漏后可导致荨麻疹或过敏反应。
实验室检测 多数使用的血清学试验为间接血凝反应及ELISA。
影像学检测 超声或CT显示内部分隔及钙化。
大体上细粒棘球绦虫囊肿常呈孤立性单房球状，直径可达35cm，可见纤维性边缘；多房棘球绦虫肝脏疾病呈多房坏死性病变，纤维性边缘缺如。
组织上细粒棘球绦虫囊肿由3层结构组成，最内层为具有细胞核的生发膜（或胚膜），形成孕囊及长出原头蚴。原头蚴代表成虫的初期头节，呈卵圆形，含有2环小钩及吸盘。中间层为寄生虫分泌的非细胞性物质，呈玻璃样、白色层状膜。最外层为肉芽组织及纤维化。较大病变可出现子囊，子囊结构类似于母囊，可由母囊的生发膜直接长出，也可由原头蚴或育囊进一步发育而成。囊可发生退行性变及仅含有脱落的小钩及钙化。嗜酸性粒细胞可不明显，但囊死亡或破坏时，可见大量嗜酸性粒细胞伴巨细胞肉芽肿。多房棘球绦虫可见多房性囊肿伴碎片状层状膜，但无有核的生发膜或原头蚴，类似恶性肿瘤侵袭坏死的肝组织。