患者一般为系统性发病，常见黄疸。实验室检测显示酶升高（肝型、於胆型或混合型），血培养可见感染性微生物。

大体上可见不同程度的肝肿大。

组织学上可见汇管区及或小叶中性粒细胞炎症浸润，不同程度的微脓肿，微脓肿内偶见细菌。小叶中心毛细胆管淤胆，汇管区周边小胆管增生伴胆汁浓缩（“胆小管淤胆”），胆管可扩张伴萎缩及扁平的上皮，单纯胆汁淤积及无明显炎症改变在败血症中常见（尤其在婴儿及儿童）。另外可见局灶肝细胞坏死、小叶中心和/或中间脂肪变性（小泡性常见）及枯否细胞增生。感染性休克患者可出现缺血性坏死（尤其在静脉周围）。

大胆管梗阻  组织上可相似，梗阻常显示胆管胆汁淤积（ductal cholestasis）而非小胆管胆汁淤积（ductular cholestasis），需要结合临床病史帮助鉴别。

药物副作用  可显示小胆管淤胆或单纯淤胆。

全胃肠外营养  可显示小胆管淤胆。

其他感染性病变  肝脏的病毒、真菌或细菌感染。

新生儿胆道闭锁  可显示小胆管淤胆。