• 小肠环孢子虫
• 坏死性小肠结肠炎
• 小肠热带口炎性腹泻
• 小肠等孢子球虫
• 肠袋炎
• 小肠微绒毛包涵体病
• Whipple病
• 自身免疫性肠病
• 小肠原发性淋巴管扩张症
• 小肠隐孢子虫病
• 异位胰腺
• 小肠耶尔森菌感染
• 小肠重复囊肿
• 消化性十二指肠炎 / 十二指肠溃疡
• 小肠细菌过度生长 / 停滞
• 胃异位
• 小肠微孢子虫
• 小肠乳糜泻
• 小肠普通变异型免疫缺陷病
• 小肠鸟-胞内分支杆菌
• 小肠麦克尔憩室
• 小肠类圆线虫感染
• 小肠结核
• 小肠贾第鞭毛虫
• 奥美沙坦肠病